2006年2月，中国科学院、深圳市人民政府及香港中文大学友好协商，在深圳市共同建立中国科学院深圳先进技术研究院（简称"深圳先进院"），实行理事会管理，探索体制机制创新。提升粤港澳地区及我国先进制造业、健康产业和现代服务业的自主创新能力，推动自主知识产权新工业建立，率先建成国际一流科研机构。 经过十六年的发展，深圳先进院目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统，由八个研究平台（中国科学院香港中文大学深圳先进集成技术研究所、生物医学与健康工程研究所、先进计算与数字工程研究所、生物医药与技术研究所、广州中国科学院先进技术研究所、脑认知与脑疾病研究所、合成生物学研究所、先进材料科学与工程研究所），国科大深圳先进技术学院，多个特色产业育成基地（深圳龙华、平湖及上海嘉定）、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构等组成。 2012年8月29日，经国家人力资源和社会保障部、全国博士后经管委批准，先进院正式设立“计算机科学与技术”博士后科研流动站，是深圳市第一个该学科的博士后科研流动站；2015年获批博士后科研工作站；2019年10月获批“生物学”博士后科研流动站；2022年获批深理工博士后创新基地资质。深圳先进院依托现有博士点、优势学科及师资力量，带动了学科博士后科研工作的稳步提升。 截止目前，先进院累计培养1988人，在站881人；其中，外籍在站32人，企业联合培养382人，双一流高校占比91%,平均年龄31岁；博新计划/国境外交流、深圳市博士启动项目共163人；中国博士后科学基金连续六年蝉联全国科研院所排名第一，累计获批资助3391万元；中科院特别研究助理24人，JCR一区文章（一作）共208人。博士后已成为我院科研力量的核心骨干，通过精准匹配博士后人才，按照“科研项目+论文+专利”灵活多样的培养模式，造就一支跨学科、复合型的博士后人才队伍。 此外，中科院深圳先进院与华为、比亚迪、富士康、大族激光、商汤等深圳市 80多家企业建立稳定实质联合合作关系，通过院企合力，培育创新型高端人才。